Di sebuah kota kecil pesisir Jepang yang tampaknya tenang bernama Kurouzu-cho (Kota Pusaran Hitam), sebuah teror tak kasat mata mulai menyebar. Bukan hantu ataupun monster, melainkan sebuah bentuk geometris abstrak: Spiral (Uzumaki).
Cerita mengikuti sudut pandang Kirie Goshima, seorang gadis SMA biasa, dan pacarnya, Shuichi Saito. Shuichi adalah orang pertama yang menyadari bahwa ada sesuatu yang salah dengan kota tersebut. Ia merasakan bahwa Kurouzu-cho sedang “terinfeksi” oleh obsesi terhadap bentuk spiral.
Awalnya, keganjilan tersebut tampak sepele: angin puyuh kecil yang muncul tiba-tiba, pola pada cangkang siput, hingga ayah Shuichi yang mulai terobsesi mengumpulkan benda-benda berbentuk spiral. Namun, obsesi itu dengan cepat berubah menjadi kegilaan yang mematikan dan grotesque.
Penduduk kota mulai mengalami transformasi fisik dan mental yang mengerikan. Tulang manusia melintir, rambut yang bergerak sendiri membentuk pola pusaran, hingga orang-orang yang berubah menjadi siput raksasa. Kirie dan Shuichi harus menyaksikan tetangga dan keluarga mereka jatuh ke dalam kegilaan, sembari berusaha mencari jalan keluar dari kota yang perlahan mengunci mereka dalam kutukan spiral abadi.