Lima puluh tahun yang lalu, makhluk misterius yang dikenal sebagai “Huge” tiba-tiba muncul di seluruh dunia, menimbulkan ancaman eksistensial bagi umat manusia. Untuk mempertahankan diri dari ancaman ini, para prajurit dalam wujud gadis remaja yang dikenal sebagai “Lilies” menggunakan energi “Magie” di dalam tubuh mereka untuk memberi daya pada senjata yang disebut “Counter Huge ARMS” atau “CHARMS.”
Setelah diselamatkan oleh seorang Lily dua tahun lalu saat evakuasi dari serangan Huge, Riri Hitotsuyanagi bersumpah untuk menjadi seorang Lily. Ia mendaftar di akademi bergengsi Yurigaoka, tempat pelatihan bagi para Lily, dan menemukan bahwa salah satu teman sekelasnya adalah Yuyu Shirai—Lily yang sama yang menyelamatkannya. Namun, yang membuatnya bingung, orang yang ia kira ceria ternyata cukup antisosial dan lebih suka bertarung sendirian. Meskipun demikian, Riri tetap ingin bergaul dengan Yuyu dan bersedia melakukan apa pun untuk mencapai tujuan itu.
Dengan Yuyu dan para Lily lainnya di sisinya, perjalanan Riri untuk menjadi salah satu dari mereka baru saja dimulai!
