Meskipun namanya berarti “putih salju”, Shirayuki adalah gadis berambut merah ceria yang tinggal di negeri Tanbarun dan bekerja keras sebagai apoteker di toko herbal miliknya. Hidupnya berubah drastis ketika ia diperhatikan oleh pangeran Tanbarun yang konyol, Pangeran Raji, yang kemudian mencoba memaksanya untuk menjadi selirnya. Tak rela melepaskan kebebasannya, Shirayuki memotong rambut merah panjangnya dan melarikan diri ke hutan. Di sana, ia diselamatkan dari Raji oleh Zen Wistalia, pangeran kedua dari negeri tetangga, dan dua ajudannya. Berharap dapat membalas budi kepada ketiganya suatu hari nanti, Shirayuki bertekad untuk mengejar karier sebagai herbalis istana di negeri Zen, Clarines.
Akagami no Shirayuki-hime menggambarkan perjalanan Shirayuki menuju kehidupan baru di istana kerajaan Clarines, serta perjuangan Zen untuk menjadi seorang pangeran yang layak menyandang gelarnya. Saat persahabatan setia terjalin dan musuh bebuyutan terbentuk, Shirayuki dan Zen perlahan belajar untuk saling mendukung saat mereka menjalani jalan mereka sendiri.