Ketika iblis pengubah bentuk yang haus akan daging manusia, yang dikenal sebagai “youma”, tiba di desa Raki, seorang wanita bermata perak berjalan memasuki kota hanya dengan pedang di punggungnya. Ia adalah seorang “Claymore”, makhluk yang diciptakan sebagai setengah manusia dan setengah youma, dengan tujuan khusus untuk membasmi monster-monster ini. Setelah keluarga Raki terbunuh, Claymore menyelamatkan nyawanya, tetapi ia kemudian diusir dari rumahnya. Karena tidak punya tujuan lain, Raki menemukan Claymore, yang dikenal sebagai Clare, dan memutuskan untuk mengikutinya dalam perjalanannya.
Seiring perjalanan mereka dari satu kota ke kota lain, mengalahkan youma di sepanjang jalan, semakin banyak hal tentang organisasi Clare dan rekan-rekan prajuritnya terungkap. Dengan setiap kota yang telah dibersihkan dan setiap iblis yang telah dihancurkan, mereka semakin dekat dengan youma tempat Clare mencari pembalasan dendam sejak ia memilih untuk menjadi seorang Claymore.
