Subaru Mikazuki adalah seorang penulis novel misteri berusia 23 tahun, seorang introvert sejati, dan pemalu yang canggung. Ia lebih suka tinggal di rumah untuk membaca buku daripada keluar dan berinteraksi dengan orang lain. Kehidupan kesendiriannya semakin diperparah oleh kematian tragis orang tuanya dalam sebuah kecelakaan bertahun-tahun yang lalu, meninggalkannya sendirian di dunia.
Suatu hari, saat memberikan persembahan di makam orang tuanya, Subaru bertemu dengan seekor kucing kecil berwarna abu-abu putih bernama Haru, yang akhirnya ia bawa pulang. Namun, Subaru belum pernah merawat orang lain seumur hidupnya—apakah ia bisa merawat kucing? Haru berterima kasih kepada Subaru, karena ia memberinya semua makanan yang ia inginkan—sebuah kemewahan bagi seekor kucing yang terbiasa hidup keras di jalanan. Namun, ia menyadari bahwa Subaru bahkan tampaknya tidak bisa merawat dirinya sendiri! Akankah ia baik-baik saja dengan si bodoh ini?
Doukyonin wa Hiza, Tokidoki, Atama no Ue. menceritakan kisah persahabatan yang tak terduga antara manusia dan kucing yang mencoba menumbuhkan pemahaman satu sama lain.
