Sejak kematian istrinya, Kouhei Inuzuka telah merawat putrinya yang masih kecil, Tsumugi, dengan sebaik-baiknya. Namun, karena minimnya pengetahuan kuliner dan kesibukannya sebagai guru, ia terpaksa bergantung pada makanan siap saji dari toko swalayan untuk memberi makan putrinya. Frustrasi karena tidak mampu menyediakan makanan segar dan bergizi untuk putrinya, Kouhei menerima tawaran dari muridnya, Kotori Iida, untuk makan malam di restoran keluarga sang murid. Namun, pada kunjungan pertama mereka, ayah dan anak itu mendapati bahwa restoran tersebut sering tutup karena ibu Kotori sedang pergi bekerja dan Kotori sering makan sendirian. Setelah banyak permohonan dari muridnya, Kouhei memutuskan untuk tetap pergi ke restoran bersama Tsumugi untuk memasak dan berbagi makanan lezat buatan rumah dengan Kotori.
Amaama to Inazuma mengikuti kisah mengharukan tentang seorang ayah yang penuh perhatian yang berusaha sekuat tenaga untuk membuat putri kecilnya yang menggemaskan bahagia, sambil mengeksplorasi makna dan nilai di balik memasak, keluarga, dan makanan hangat di rumah yang sering dianggap remeh.
