Koyomi Araragi, seorang siswa SMA kelas tiga, berhasil selamat dari serangan vampir berkat bantuan Meme Oshino, seorang pria aneh yang tinggal di sebuah bangunan terbengkalai. Meskipun telah diselamatkan dari vampirisme dan kini menjadi manusia kembali, beberapa efek samping seperti kemampuan penyembuhan super dan penglihatan yang lebih baik masih tersisa. Meskipun demikian, Araragi berusaha menjalani kehidupan layaknya siswa normal, dengan bantuan teman sekaligus ketua kelasnya, Tsubasa Hanekawa.
Ketika teman sekelasnya, Hitagi Senjougahara, jatuh dari tangga dan ditangkap oleh Araragi, sang pemuda menyadari bahwa gadis itu ternyata tidak berbobot. Meskipun Senjougahara protes, Araragi bersikeras untuk membantunya, dan memutuskan untuk meminta bantuan Oshino, pria yang pernah membantunya mengatasi kesulitannya sendiri.
Melalui beberapa kisah yang melibatkan iblis dan dewa, Bakemonogatari mengikuti Araragi dalam upayanya membantu mereka yang menderita penyakit supernatural.
