Saikin, Imouto no Yousu ga Chotto Okashiinda ga. mengisahkan sebuah keluarga yang baru saja mulai membangun kembali keluarga mereka. Ketika mereka menikah, Tuan dan Nyonya Kanzaki membawa serta putra dan putri remaja mereka. Namun, Mitsuki Kanzaki, siswa baru SMA, kurang antusias. Terluka oleh sejarah sosok ayah yang tidak ada dan kasar, ia lambat menerima ayah tiri dan saudara tirinya.
Namun setelah sebuah kecelakaan membuat Mitsuki dirawat di rumah sakit, ia mendapati dirinya dirasuki oleh hantu Hiyori Kotobuki, seorang gadis seusianya yang sangat mencintai saudara tiri Mitsuki, Yuuya. Hiyori tidak dapat meneruskan hadiah terakhirnya karena cintanya yang tak terbalas kepada Yuuya, yang berarti ia harus mewujudkannya… di dalam tubuh Mitsuki?!
Sekarang, hidup Mitsuki bergantung pada bagaimana ia bisa membawa Hiyori ke Surga. Akankah ia terbiasa berbagi dirinya dengan hantu yang agresif dan penuh cinta? Bisakah ia mengatasi ketidakpercayaannya terhadap keluarga barunya? Bisakah dia memenuhi perasaan Hiyori terhadap Yuuya? Dan mungkinkah dia menyembunyikan beberapa perasaannya sendiri?
